De serie speelt zich af in Zweden rond een 14-jarige jongen genaamd Nils Holgersson. Nils is een nietsnut die alleen maar kattenkwaad uithaalt en dieren plaagt. Op een dag vangt hij een kabouter die hem als straf zelf in een kabouter verandert. Nils ontvlucht als kabouter de boerderij waar hij woont en reist mee met een groep wilde ganzen naar Lapland. Onderweg leert hij enkele belangrijke levenslessen.