Vijf jaar na de avonturen in The Lego Movie verplaatst Bianca, het jongere zusje van Finn, de Lego-creaties van haar broer naar de kelder, waar ze het speelgoed combineert met haar eigen Duplo-blokken. De inwoners van het LEGO-universum lijden onder de verandering. Hun wereld verandert in een post-apocalyptisch landschap en wordt aangevallen door de Duplo-generaal Sweet Mayhem.